史密斯在被尼奥终结后由于悖论（因为在尼奥终结史密斯前是史密斯杀了尼奥，而尼奥的“复活”又是程序设定以外的，所以本应该按程序已死的人反而杀死了杀他的人，这样系统就陷入一个死循环，既编的系统程序无法计算出史密斯被死人终结的结果，于是拒绝删除史密斯）成了一个病毒程序，他感染了先知程序，把先知程序变成了自己病毒程序的一个拷贝——就好像我们现在电脑里的正常文件被病毒感染后转成了病毒的帮凶一样。

尼奥被史密斯复制后获得了史密斯的原始代码，这样系统就可以通过把他们两个一起删除（就是计算为他们两个一起死亡）来结束系统死循环。也就是我们现在的杀毒＋修复Bug，把被感染的程序恢复到原样。于是被感染的先知程序就恢复原样了。

黑客帝国为什么尼奥（主角）是救世主，救世主的作用是什么？高手进

首先说《黑客帝国》系列电影确实十分经典，个人比较喜欢。

现在回答楼主问题，电影里设定的背景十分完美，首先楼主要明白一个道理，救世主是为母体服务的，那母体又是为谁服务的？不用怀疑，母体是为人类服务的，只是服务的方法有点那个啦，没有人的存在，母体就没有存在的价值。那救世主为什么存在？又怎样服务呢？很显然，母体不能完全控制人类，有一部分人类会摆脱母体的控制而苏醒过来，进而与母体争夺世界的控制权，（或者说是母体让这一部分人苏醒过来的，为了让他们明白一些道理），这时当然要一个BUG的存在来进行双方的制约或者说为双方达成一个共处的协议，这就是救世主存在的意义。

要说救世主是母体编写的程序是不对的，应该说是拥有人类完整意识的程序（但是完全属于人），这样的BUG不能太多，所以就尼奥特殊啰，他不是为了对抗苏醒的人，而是要成为这些人的一份子，去影响他们，让他与他们在同母体的斗争中知道“母体不能缺少人，人也不能缺少母体”这个道理，从而在他的带领下人们相信他，而他相信母体，这样人类与母体就有了一段时间的和平，就这样反复着，人类不断的反思他们的世界观，当有一天人类真正的明白了他们要如何去爱护世间的一切，明白了什么才是人比电脑真正强大（我觉得应该是人类的大爱）的所在，那时母体才会与人类一起完善世界。

先知，我觉得先知就是母体为自己创造的一个拥有人类意识（但完全属于程序）的另一个可以得到人类信任，指引救世主向我上面说的那样去影响人类的BUG，可以说先知是一个很无敌的设定，有点像程序里的超级间谍（但先知是母体建立的），我觉得可以说先知是母体在影响人类方面的一个大胆尝试，换句话说“先知就像是为了人民而化装成叛军的国王”一方面与叛军和睦相处，为了人类的未来去引导救世主，一方面又不能在虚拟世界里被程序清理员发现其真实身份，可谓用心良苦啊。

大家觉得我们是生活在现实世界呢？还是，母体创造的虚拟世界呢？

纯手打，个人见解，大家觉得好就顶个O(∩_∩)O~